粤港澳高校联盟由中山大学率先倡议并与香港中文大学和澳门大学共同发起，于2016年11月15日正式成立，迄今已汇聚中华人民共和国粤港澳三地40所高校。成员包括：

广东24所：中山大学、华南理工大学、暨南大学、华南师范大学、华南农业大学、广东工业大学、广东外语外贸大学、广州中医药大学、南方科技大学、南方医科大学、深圳大学、汕头大学、清华大学深圳国际研究生院、哈尔滨工业大学（深圳）、北京师范大学、广州大学、广州医科大学、东莞理工学院、佛山科学技术学院、五邑大学、广东海洋大学、香港中文大学（深圳）、广东财经大学、广东石油化工学院

香港9所：香港中文大学、香港大学、香港科技大学、香港城市大学、香港浸会大学、香港理工大学、 岭南大学、香港教育大学、香港公开大学

澳门7所：澳门大学、澳门科技大学、澳门城市大学、澳门理工学院、澳门旅游学院、澳门镜湖护理学院，圣若瑟大学